Hasta 1973 las unidades de riego se concentraban en el valle de Banderas y al margen izquierdo del Río Santiago. Después se han incorporado la margen derecha del San Pedro y la del Santiago, y se han hecho obras de riego en la región sur: Ahuacatlán, Jala, Ixtlán, San Pedro Lagunillas. El proyecto Aguamilpa (1989-1993) pretende controlar el río Santiago mediante la presa del mismo nombre y dar riego a 120 000 hectáreas.
